Povijest rukometa u Zaprešiću seže u 50-te godine prošlog stoljeća, a grad Zaprešić se prema tome smatra jednim od prvih rukometnih središta na prostorima današnje Hrvatske. Tijekom svog razvoja klub je mijenjao ime nekoliko puta, a najveći uspjeh postigao je pod imenom „Partizan“ u drugoj republičkoj ligi. Nekadašnji rukometaši zaprešićkog „Partizana“, danas su uspješni pojedinci i intelektualci.
S vremenom, klub mijenja naziv u „RK Zaprešić“ koji nastavlja s kvalitetnim radom i daje mnoga poznata rukometna imena kao što su Davorin Gajnik –reprezentativac Jugoslavije i igrač RK Medveščak, Denis Špoljarić – hrvatski reprezentativac, svjetski prvak i olimpijski pobjednik s međunarodnim iskustvom, Krunoslav Pipinić i Marko Zurunić – prvoligaški igrači također s međunarodnim iskustvom.
Klub je u sezoni 1993./94. ušao i 1. HRL, no zbog financijskih razloga sa završetkom kalendarske 1993. godine s radom prestaje škola rukometa, dok sredinom 1994. godine s radom prestaje i sami klub. Prestanak djelovanja kluba iz Zaprešića trajao je sve do početka rujna 1999. godine, kada je skupina rukometnih entuzijasta i članova nekadašnjeg kluba osnovala današnji MRK Zaprešić. Novi klub započeo je svoj put u 2. županijskoj rukometnoj ligi te je postepeno napredovao do 1. HRL Sjever gdje se natječe i danas.
Osim seniorske ekipe, klub ima i svoju školu rukometa koja je kroz godine razvila mnoštvo igrača koji su konkurirali i nastupali u seniorskoj momčadi kluba. Neki od uspješnijih pojedinaca proizašlih iz naše škole rukometa, a sa prvoligaškim iskustvom u drugim klubovima su Borna Hadrović, Filip Radić, Jan Kovačec (juniorski reprezentativac) te Matija Kozolić.
Danas je škola rukometa, odnosno momčadi mlađih uzrasta (U9, U11, U13, U15, U17), nadograđena s projektom pod nazivom „Škola rukometa“ koji za cilj ima približiti sport i aktivan način života najmlađima, naučiti ih sportsko-socijalnim vještinama koje će im služiti u svim aspektima života.
Uz projekt „Škola rukometa“ kao jedan od najvećih uspjeha kluba nakon 1999. godine ističe se naslov prvaka u 2. HRL Sjever u sezoni 2023./24. te plasman u viši natjecateljski rang, odnosno 1. HRL Sjever. Osim toga u sezoni 2021./22. MRK Zaprešić je osvojio naslov prvaka 3. HRL Središte i time ušao u 2. HRL Sjever gdje je odigrao dvije sezone prije plasmana u prvu ligu. Također, klub svake godine organizira međunarodni rukometni turnir Memorijal Ivica Birovčec – turnir u spomen na velikog prijatelja kluba i rukometa u Zaprešiću.
MRK Zaprešić je u 2024. godini imao više razloga za slavlje. Osim plasmana seniorske ekipe u prvu ligu, klub slavi 25 godina postojanja u ovom obliku. No, s obzirom na dugogodišnju povijest rukometa u Zaprešiću, ove godine obilježava i 70 godina rukometa. Proslava ovih značajnih obljetnica prilika je da se prisjetimo svih uspjeha, ali i da se zahvalimo svim članovima, igračima, trenerima, volonterima, sponzorima i navijačima koji su doprinijeli razvoju kluba. Posebnu zahvalnost dugujemo Ivici Birovčecu, čiji je doprinos bio ključan za opstanak i napredak kluba.